Hypnoterapi støttes opp av vitenskapelig forskning og har demonstrert effektiviteten for en rekke tilstander og formål. Det anses som en trygg og noninvasiv metode, men det er dog noen risikoer og motsetninger som man burde være klar over.
Det kan være at individer med visse psykologiske tilstander, som for eksempel schizofreni eller andre psykotiske lidelser, ikke egner seg som kandidater for hypnoterapi. I noen sjeldne tilfeller kan individer oppleve milde og midlertidige fysiske bivirkninger under hypnose, som for eksempel svimmelhet, kvalme eller hodepine.
Det er viktig å merke seg at selv om hypnose kan være svært effektivt for mange individer, kan det hende at ikke alle oppnår ønskede resultater. Individers mottakelighet og motivasjon er betydelige faktorer som kan påvirke hvor effektivt hypnoterapi er.